1. 부대
해당 부대들은 해상막료감부 휘하에 놓인다.- 자위함대(自衛艦隊)[1]
- 호위함대(護衛艦隊)[2]
- 제1호위대군(第1護衛隊群)[3] (요코스카)
- 제1호위대(第1護衛隊) (요코스카)
- DDH-183 이즈모급 헬기 탑재 호위함 이즈모(いずも)
- DDG-179 마야급 미사일 호위함 마야(まや)
- DD-101 무라사메급 호위함 무라사메(むらさめ)
- DD-107 무라사메급 호위함 이카즈치(いかづち)
- 제5호위대(第5護衛隊) (사세보)
- 제2호위대군(第2護衛隊群) (사세보)
- 제2호위대(第2護衛隊) (사세보)
- DDH-182 휴우가급 헬기 탑재 호위함 이세(いせ)
- DDG-178 아타고급 미사일 호위함 아시가라(あしがら)
- DD-102 무라사메급 호위함 하루사메(はるさめ)
- DD-154 아사기리급 호위함 아마기리(あまぎり)
- 제6호위대(第6護衛隊) (요코스카)
- 제3호위대군(第3護衛隊群) (마이즈루)
- 제3호위대(第3護衛隊) (마이즈루)
- DDH-181 휴우가급 헬기 탑재 호위함 휴가(ひゅうが)
- DDG-177 아타고급 미사일 호위함 아타고(あたご)
- DDG-175 공고급 미사일 호위함 묘코(みょうこう)
- DD-118 아키즈키급 호위함 후유즈키(ふゆづき)
- 제7호위대(第7護衛隊) (오오미나토)
- 제4호위대군(第4護衛隊群) (구레)
- 제4호위대(第4護衛隊) (구레)
- DDH-184 이즈모급 헬기 탑재 호위함 가가(かが)
- DD-105 무라사메급 호위함 이나즈마(いなづま)
- DD-106 무라사메급 호위함 사미다레(さみだれ)
- DD-113 다카나미급 호위함 사자나미(さざなみ)
- 제8호위대(第8護衛隊) (사세보)
- 지역배비부대(地域配備部隊)
- 제11호위대(第11護衛隊) - 요코스카지방대 배속
- 제12호위대(第12護衛隊) - 구레지방대 배속
- 제13호위대(第13護衛隊) - 사세보지방대 배속
- 제14호위대(第14護衛隊) - 마이즈루지방대 배속
- 제15호위대(第15護衛隊) - 오미나토지방대 배속
- 해상훈련지휘군(海上訓練指導隊群) (요코스카)
- 요코스카, 구레, 사세보, 마이즈루, 오미나토 해상 훈련지도대, 해상전술 개발지도대
- 제1해상보급대(第1海上補給隊) (요코스카)
- AOE-422 토와다급 보급함 토와다(とわだ) - 구레 기지
- AOE-423 토와다급 보급함 토키와(ときわ) - 요코스카 기지
- AOE-424 토와다급 보급함 하마나(はまな) - 사세보 기지
- AOE-425 마슈우급 보급함 마슈우(ましゅう) - 마이즈루 기지
- AOE-426 마슈우급 보급함 오우미(おうみ) - 사세보 기지
- 제1해상훈련지원대(第1海上訓練支援隊) (구레)
- ATS-4202 쿠로베급 훈련지원함 쿠로베(くろべ)
- ATS-4203 쿠로베급 훈련지원함 텐류(てんりゅう)
- 항공집단(航空集団)
- 제1항공군(第1航空群)[4]
- 제2항공군(第2航空群)
- 제2항공대(第2航空隊)
- 제2정비보급대(第2整備補給隊)
- 하치노에항공기지대(八戸航空基地隊)
- 제4항공군(第4航空群)
- 제4항공대(第4航空隊)
- 제4정비보급대(第4整備補給隊)
- 아쓰키항공기지대(厚木航空基地隊)
- 이오지마항공기지대(硫黄島航空基地隊)
- 미시마항공파견대(南鳥島航空派遣隊)
- 제5항공군(第5航空群)
- 제5항공대(第5航空隊)
- 제5정비보급대(第5整備補給隊)
- 나하항공기지대(那覇航空基地隊)
- 제21항공군(第21航空群)
- 제21항공대(第21航空隊)
- 제211비행대(第211飛行隊)
- 제212비행대(第212飛行隊)
- 제213비행대(第213飛行隊)
- 이오지마항공분견대(硫黄島航空分遣隊)
- 제23항공대(第23航空隊)
- 제231비행대(第231飛行隊)
- 제231정비보급대(第231整備補給隊)
- 마이즈루항공기지대(舞鶴航空基地隊)
- 제25항공대(第25航空隊)
- 제251비행대(第251飛行隊)
- 제251정비보급대(第251整備補給隊)
- 오미나토항공기지대(大湊航空基地隊)
- 제73항공대(第73航空隊)
- 이오지마항공분견대(硫黄島航空分遣隊)
- 오미나토항공분견대(大湊航空分遣隊)
- 제21정비보급대(第21整備補給隊)
- 다테야마항공기지대(館山航空基地隊)
- 제22항공군(第22航空群)
- 제22항공대(第22航空隊)
- 제221비행대(第221飛行隊)
- 제222비행대(第222飛行隊)
- 제223비행대(第223飛行隊)
- 카노야항공분견대(鹿屋航空分遣隊)
- 제24항공대(第24航空隊)
- 제241비행대(第241飛行隊)
- 제241정비보급대(第241整備補給隊)
- 코마츠시마항공기지대(小松島航空基地隊)
- 제22정비보급대(第22整備補給隊)
- 오무라항공기지대(大村航空基地隊)
- 제31항공군(第31航空群) (이와쿠니 비행장)
- 제71항공대(第71航空隊)
- 제81항공대(第81航空隊)
- 제811비행대(第811飛行隊)
- 제812비행대(第812飛行隊)
- 제91항공대(第91航空隊)
- 제31정비보급대(第31整備補給隊)
- 표적기정비대(標的機整備隊)
- 이와쿠니항공기지대(岩国航空基地隊)
- 제51항공대(第51航空隊)
- 제61항공대(第61航空隊)
- 제111항공대(第111航空隊)
- 제1항공수리대(第1航空修理隊)
- 제2항공수리대(第2航空修理隊)
- 항공관제대(航空管制隊)
- 기동시설대(機動施設隊)
- 잠수함대(潜水艦隊) (요코스카)
- 제1잠수대군(第1潜水隊群) (구레)
- 직할함
- ASR-403 치하야 잠수함 구조함(ちはや)
- 제1잠수대
- SS-507 소류급 잠수함 진류(じんりゅう)
- SS-510 소류급 잠수함 쇼류(しょうりゅう)
- SS-593 오야시오급 잠수함 마키시오(まきしお)
- SS-594 오야시오급 잠수함 이소시오(なるしお)
- 제3잠수대
- SS-504 소류급 잠수함 켄류(けんりゅう)
- SS-511 소류급 잠수함 오류(おうりゅう)
- SS-596 오야시오급 잠수함 쿠로시오(くろしお)
- SS-600 오야시오급 잠수함 모치시오(もちしお)
- 제5잠수대
- 구레 잠수함 기지대
- 제2잠수대군(第2潜水隊群) (요코스카)
- 직할함
- ASR-404 치요다 잠수함 구조함(ちよだ)
- 제2잠수대
- 제4잠수대
- SS-513 타이게이급 잠수함 타이게이(たいげい)
- SS-505 소류급 잠수함 즈이류(ずいりゅう)
- SS-598 오야시오급 잠수함 야에시오(やえしお)
- SS-599 오야시오급 잠수함 세토시오(せとしお)
- 제6잠수대
- 요코스카 잠수함 기지대
- 잠수함교육훈련대(潜水艦教育訓練隊)
- 제1연습잠수대(第1練習潜水隊)
- 요코스카잠수함교육훈련분견대(横須賀潜水艦教育訓練分遣隊)
- 소해대군(掃海隊群)
- 소해대군사령부 - 요코스카
- 직할함
- 제1소해대(第1掃海隊) - 요코스카
- 제2소해대(第2掃海隊) - 사세보
- 제3소해대(第3掃海隊) - 구레
- 상륙전・소해전전술지원대(水陸両用戦・機雷戦戦術支援隊) - 요코스카
- 구레상륙전・소해전전술지원대(呉水陸両用戦・機雷戦戦術支援分遣隊) - 구레
- 제1수송대(第1輸送隊) - 구레
- 정보업무군(情報業務群)
- 작전정보지원대(作戦情報支援隊)
- 기초정보지원대(基礎情報支援隊)
- 전자정보지원대(電子情報支援隊)
- 해양업무군(海洋業務群)
- 대잠자료대(対潜資料隊)
- 기상자료관리대(気象資料管理隊)
- 오키나와해양관측소(沖縄海洋観測所)
- 시모키타해양관측소(下北海洋観測所)
- 개발대군(開発隊群)
- 지휘통신개발대(指揮通信開発隊)
- 함정개발대(艦艇開発隊)
- 항공프로그램개발대(航空プログラム開発隊)
- 가고시마시험소(鹿児島試験所)
- 특별경비대(特別警備隊): 해상자위대 소속의 특수부대이다.
- 호위함 입입검사대(護衛艦付き立入検査隊) : 각 호위함마다 배속된, 공해상 선박 차단 임무를 맡은 특수부대.
- 요코스카지방대(横須賀地方隊)
- 제41소해대(第41掃海隊)
- 요코스카경비대(横須賀警備隊)
- 요코스카교육대(横須賀教育隊)
- 요코스카탄약정비보급소(横須賀弾薬整備補給所)
- 요코스카조수보급소(横須賀造修補給所)
- 요코스카기지업무대(横須賀基地業務隊)
- 요코스카위생대(横須賀衛生隊)
- 요코스카음악대(横須賀音楽隊)
- 지치시마기지분견대(父島基地分遣隊)
- 구레지방대(呉地方隊)
- 구레경비대(呉警備隊)
- 구레교육대(呉教育隊)
- 구레탄약정비보급소(呉弾薬整備補給所)
- 구레조수보급소(呉造修補給所)
- 구레기지업무대(呉基地業務隊)
- 구레위생대(呉衛生隊)
- 구레음악대(呉音楽隊)
- 한신기지대(阪神基地隊)
- 제42소해대(第42掃海隊)
- 유라기지분견대(由良基地分遣隊)
- 가리야자기측정소(仮屋磁気測定所)
- 기이경비소(紀伊警備所)
- 사세보지방대(佐世保地方隊)
- 사세보경비대(佐世保警備隊)
- 사세보교육대(佐世保教育隊)
- 사세보탄약정비보급소(佐世保弾薬整備補給所)
- 사세보조수보급소(佐世保造修補給所)
- 사세보자기측정소(佐世保磁気測定所)
- 사세보기지업무대(佐世保基地業務隊)
- 사세보위생대(佐世保衛生隊)
- 사세보음악대(佐世保音楽隊)
- 해상자위대사세보사료관(海上自衛隊佐世保史料館)
- 시모노세키기지대(下関基地隊)
- 제43소해대(第43掃海隊)
- 무쓰루경비소(六連警備所)
- 오키나와기지대(沖縄基地隊)
- 제46소해대(第46掃海隊)
- 오키나와수중처분대(沖縄水中処分隊)[8]
- 쓰시마방비대(対馬防備隊)[9]
- 이키경비소(壱岐警備所)
- 가미쓰시마경비소(上対馬警備所)
- 시타쓰시마(下対馬警備所)
- 아마미기지분견대(奄美基地分遣隊)
- 마이즈루지방대(舞鶴地方隊)
- 제44소해대(第44掃海隊)
- 마이즈루경비대(舞鶴警備隊)
- 마이즈루교육대(舞鶴教育隊)
- 마이즈루탄약정비보급소(舞鶴弾薬整備補給所)
- 마이즈루조수보급소(舞鶴弾薬整備補給所)
- 마이즈루기지업무대(舞鶴基地業務隊)
- 마이즈루위생대(舞鶴衛生隊)
- 마이즈루음악대(舞鶴音楽隊)
- 오미나토지방대(大湊地方隊)
- 오미나토경비대(大湊警備隊)
- 오미나토탄약정비보급소(大湊弾薬整備補給所)
- 오미나토조수보급소(大湊造修補給所)
- 오미나토기지업무대(大湊基地業務隊)
- 오미나토위생대(大湊衛生隊)
- 오미나토음악대(大湊音楽隊)
- 하코다테기지대(函館基地隊)
- 제45소해대(第45掃海隊
- 마쓰마에경비소(松前警備所)
- 닷피경비소(竜飛警備所)
- 요이치방비대(余市防備隊)
- 제1미사일정대(第1ミサイル艇隊)
- 왓카나이기지분견대(稚内基地分遣隊)
- 교육항공집단(教育航空集団)
- 시모후사교육항공군(下総教育航空群)[10]
- 도쿠시마교육항공군(徳島教育航空群)
- 오즈키교육항공군(小月教育航空群)
- 제211교육항공대(第211教育航空隊)
- 연습함대사령부(練習艦隊司令部) (구레)
- 직할함
- TV-3508 연습함 카시마(かしま)
- 제1연습대
- 시스템통신대군(システム通信隊群)
- 중앙시스템통신대(中央システム通信隊)
- 요코스카시스템통신대(横須賀システム通信隊)
- 구레시스템통신대(呉システム通信隊)
- 사세보시스템통신대(佐世保システム通信隊)
- 마이즈루시스템통신대(舞鶴システム通信隊)
- 오미나토시스템통신대(大湊システム通信隊)
- 이동통신대(移動通信隊)
- 보전감사대(保全監査隊)
- 해상자위대경무대(海上自衛隊警務隊)[11]
- 잠수의학실험대(潜水医学実験隊)
- 인쇄보급대(印刷補給隊)[12]
- 도쿄업무대(東京業務隊)[13]
- 도쿄음악대(東京音楽隊)[14]
2. 기타 기관
- 해상자위대간부학교(海上自衛隊幹部学校): 한국의 現 해군대학에 해당한다.
- 해상자위대간부후보생학교(海上自衛隊幹部候補生学校): 해상자위대 장교를 양성하는 교육기관이다.
- 해상자위대제1술과학교(海上自衛隊第1術科学校): 해상자위대 교육훈련을 참고할 것.
- 해상자위대제2술과학교(海上自衛隊第2術科学校)
- 해상자위대제3술과학교(海上自衛隊第3術科学校)
- 해상자위대제4술과학교(海上自衛隊第4術科学校)
- 해상자위대보급본부(海上自衛隊補給本部): 창급 부대이다.
- 해상자위대함선보급처(海上自衛隊艦船補給処)
- 해상자위대항공보급처(海上自衛隊航空補給処)
3. 자위대병원
- 자위대오미나토병원(自衛隊大湊病院)
- 자위대요코스카병원(自衛隊横須賀病院)
- 자위대마이즈루병원(自衛隊舞鶴病院)
- 자위대구레병원(自衛隊呉病院)
- 자위대사세보병원(自衛隊佐世保病院)
[1] 자위함대는 한국 해군의 해군작전사령부에 상당한다.[2] 자위함대를 제외한 함대는 한국의 함대에 상당하나 지휘관인 함대사령관은 중장이다.[3] 대군(隊群)은 전단에 상당한다. 단 전단장인 대군사령관은 소장이 보임된다. 준장이 없기 때문이다.[4] 비행단급 부대로 공자대에서 비행군(飛行群)이 전대급인 것과 달리 해자대에선 항공군(航空群)이 전단급이다.[5] 항공대는 비행전대에 상당한다.[6] 정비보급대는 군수전대에 상당한다.[7] 항공기지대는 기지전대에 상당한다.[8] 수중처분은 기뢰 및 EOD 제거를 뜻한다.[9] 쓰시마경비대와 같이 쓰시마에 있는 자위대 부대이다. 인원은 240명 수준.[10] 위의 항공집단 소속 항공군과 달리 교육항공군들은 지휘관이 대령이다.[11] 헌병대로 헌병감에 해당하는 경무대장은 대령이 보임된다.[12] 대한민국의 국군인쇄창에 상당한다. 과거엔 해군인쇄창.[13] 해상막료감부가 주둔한 방위성 청사의 부대로 한국으로 치면 계룡대 근무지원단.[14] 해상자위대의 군악대이다.