1. 운항 노선
취항 계획은 발표되었으나 아직 운항을 시작하지 않은 노선은 취소선으로 처리한다.| 국가 | 도시 | 공항 | 편명 | 운항횟수 |
| 정기편 | ||||
| [[일본|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 도쿄 | 나리타 국제공항 | YP731/YP732 | 5회/주[1] |
| [[태국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 방콕 | 수완나품 국제공항 | YP601/YP602 | 5회/주[2][3] |
| [[미국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 로스앤젤레스 | 로스앤젤레스 국제공항 | YP101/YP102 | 7회/주 |
| 뉴욕(뉴어크) | 뉴어크 리버티 국제공항 | YP131/YP132 | 5회/주[4][5] | |
| 샌프란시스코 | 샌프란시스코 국제공항 | YP111/YP112 | 4회/주[6] | |
| [[베트남|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | | | | |
| [[홍콩|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | | | | |
2. 향후 취항 계획
모두 인천 발착으로 운항될 노선이다.현재 목록에 있는 노선은 에어프레미아가 취항을 검토 중이라 발표한 것이다. 신규 항공기 도입 시기와 향후 예상 수요 및 운수권 문제 해결에 따라 천천히 취항할 것으로 보인다.
2018~2019년 공식 취항 전 발표 자료는 다음과 같다.
국토부 면허 발급 보도자료('19.3.5) 및 면허 신청 공고('18.11.16)에 기재된 취항 계획이다. 괄호 안은 면허 신청 시 제출한 주간 운항 횟수며, 경영권 싸움 이후 변경된 사항이다.
자세한 도시 이름은 언급되지 않았지만 항공기가 추가 도입이 되는데로 2025년 1월 이후부터 미주와 홍콩, 동남아 등의 노선에 신규 취항할 예정이다.
| 국가 | 도시 | 공항 | 편명 | 운항횟수 |
| 향후 운항 노선 | ||||
| [[미국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 시애틀 | 시애틀 타코마 국제공항 | 미정 | 미정 |
| [[일본|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 오사카 | 간사이 국제공항 | ||
| 나고야 | 센트레아 나고야 중부국제공항 | |||
| 후쿠오카 | 후쿠오카 공항 | |||
| [[중국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 시안 | 시안 셴양 국제공항 | ||
| 선전 | 선전 바오안 국제공항 | |||
| [[베트남|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 하노이 | 노이바이 국제공항 | ||
| [[필리핀|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 마닐라 | 니노이 아키노 국제공항[10] | ||
| [[인도네시아|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 자카르타 | 수카르노 하타 국제공항 | ||
| [[태국|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 푸켓 | 푸켓 국제공항 | ||
| [[캐나다|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 밴쿠버 | 밴쿠버 국제공항 | ||
| [[프랑스|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | | 미정[12] | ||
| [[이탈리아|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 로마 | 레오나르도 다 빈치 국제공항[13] | ||
| [[호주|]][[틀:국기|]][[틀:국기|]] | 미정 | 미정[14] | ||
3. 과거 운항 노선
에어프레미아가 과거에 운항했던 노선들이다. 김포~제주 구간을 제외하면 전부 인천 발착이다.2021년 8월 11일부터 10월 30일까지 김포~제주 노선에 취항했다.
2022년 8월 27일부터 11월 5일까지 여행사 전세편으로 인천~앙카라 노선에 부정기편으로 취항했다. 그리고 동년 12월 29일부터 2023년 3월 16일까지 여행사 전세편 겸 부정기편으로 재취항했다.
2022년 7월 15일부터 2023년 3월 25일까지 정기편으로 인천~싱가포르 노선을 운항했다.
2023년 5월 11일부터 8월 10일까지, 2024년 6월 11일부터 8월 13일까지 부정기편으로 인천~오슬로 노선에 운항했다.
2022년 10월 2일부터 2023년 9월 1일까지 정기편으로 인천~호찌민 노선을 운항했다.
2023년 6월 23일부터 12월 29일까지 정기편으로 인천~프랑크푸르트 노선을 운항했다.
2023년 12월 31일부터 2024년 3월 4일까지 부정기편으로 인천~호놀룰루 노선을 운항했다.
2023년 9월 11일부터 2024년 3월 11일까지 부정기편으로 인천~바르셀로나 노선을 운항했다.
| 도시 | 공항 | 편명 | 운항횟수 |
| 국내선 | |||
| 서울 | 김포국제공항 | YP541/YP545 | 2회/일 |
| 제주 | 제주국제공항 | YP542/YP546 | |
| 국제선 | |||
| 싱가포르 | 싱가포르 창이 공항 | YP631/YP632 | 4회/주 |
| 호찌민 | 떤선녓 국제공항 | YP651/YP652 | |
| 프랑크푸르트 | 프랑크푸르트 공항 | YP231/YP232 | |
| 부정기편 | |||
| 앙카라 | 앙카라 에센보아 공항 | YP5201/YP5202 | 1회/주[15] |
| 오슬로 | 오슬로 공항 | YP5211/YP5212 | 1~2회/주[16] |
| 호놀룰루 | 다니엘 K. 이노우에 국제공항 | YP5151/YP5152 | 4회/주[17] |
| 바르셀로나 | 바르셀로나 엘 프라트 국제공항 | YP5245/YP5246 | 2회/주[18] |
[1] 화, 목요일 제외 매일 운항[2] 월, 금요일 제외 매일 운항[3] 2025년 1월 24일부터 주 5회에서 주 7회로 증편 예정.#[4] 월, 수, 목, 금, 일요일[5] 2025년 1월 7일부터 주 5회에서 주 6회로 증편예정.#[6] 월, 수, 금, 일요일[7] 2025년 1월 23일 신규 취항[8] 월, 화, 금요일 제외 매일 운항[9] 2025년 1월 24일부터 월, 수, 금, 일요일 취항 예정[10] 2024년 5월에 주 2,240석을 공급하는 조건으로 운수권을 취득했다.#[11] 프랑스과의 항공 협정에서 취항이 가능한 국적사는 2곳으로 제한되어 있는데, 본래 대한항공이 아시아나항공의 인수를 전제로 아시아나항공이 가지고 있는 운수권을 양도하기로 하였으나 티웨이로 노선을 틀어 티웨이항공이 파리에 취항하면서 파리 취항은 요원한 상황이다.[12] 취항한다면 파리 샤를 드골 공항이 유력했다.[13] 이곳 역시 티웨이항공이 취항하면서 에어프레미아의 취항에 어려움이 생겼다.[14] 2024년 5월에 주 1,241석 공급 조건으로 호주의 운수권을 취득했다.#[15] 첫 번째 부정기편은 토요일, 두 번째 부정기편은 목요일에 운항했었다.[16] 첫 번재 부정기편은 목요일에 고정 운항하며, 일부 기간중 월요일 추가 운항했었다. 두 번째 부정기편은 화요일에 고정 운항하며, 일부 기간 중 목요일 추가 운항했었다.[17] 월, 수, 금, 일요일에 운항했었다.[18] 월, 목요일에 운항을 했었다.