정복모드에서는 플레이어들이 방어 병력으로 구성해놓은 영지를 탈환하면서 싸울 수 있다. 주의사항으로는 한번 싸우고나면 모험모드와는 다르게 그 날동안은 체력이 차지 않는다. 1회 생명력 무료 회복을 지원해주니 적당히 아껴서 쓰는 것이 좋다. 영지 보유 수에 따라 정복상점 보상을 얻을 수 있는데 이걸로 정복상점에서 원하는 아이템을 구입할 수 있다.
초창기에 세계 정복2는 등용 시스템이 없어서 조각 소환으로 영웅을 집급해야했고 고랭커 및 과금 위주의 헤비 플레이어들은 세계석들을 이용해 지속적으로 과금을 해왔다. 하지만, 무과금들에게도 이러한 영웅 조각이 얻기 쉬워지는 등용제도가 도입되면서 이전까지 과금해온 유저들을 호구로 만든다는 이야기가 많이 나오게 되었고 결국 그로 인해 패치가 시작되고 떠나는 사람이 많아졌다.
안그래도 이전부터 좋았던 이순신을 더 버프시키면서 패키지를 팔아서 15만원 정도 투자하면 +5성을 얻을 수 있게 하던 엄청난 패키지를 판매하기 시작했다. 이로 인해 대부분 유저들이 5성 이순신을 가지기 위해서 과금을 했고 등용시스템과 더불어 유저들의 덱이 엄청나게 세지기 시작하면서 게임의 컨텐츠가 오히려 엄청 소모되었다. 즉, 할것이 많이 없어져버렸다. 운영진들도 이후로는 이러한 패키지를 안내놓는다고 했지만오히려 그런 말 때문에 구매한 사람이 더욱 늘어나버렸다.
아서가 상당히 좋은 스펙이었던 탓에 과금러들이 무조건 키우고 보는 캐릭터였지만 너프를 먹게 되자 과금러들이 항의하기 시작했다. 물론, 밸런스를 맞추는 건 좋은 현상이지만 운영진들이 하향보다는 상향 밸런스를 선호한다고 했기에 이 점에서 문제가 되었었다. 물론 과금러들도 아서의 너프를 예측하긴 했지만 이에 대한 보상이 전혀 없었다는 점에도 아쉬운 부분..