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총 12개의 미션으로 나누어져 있고 작중 시점은 상위 문서에서 말했던 것처럼 헤일로 워즈의 28년 후, 헤일로 5의 1년 후의 시간대. 그들이 깨어난 곳은 바로 아크의 상공으로 어찌된 이유로 이곳에 온 건지 파악하지 못하고 있었다. 하지만 아크의 지표선에서 UNSC의 신호가 감지되어 제롬을 비롯한 스파르탄 팀을 보내 정찰을 보내기로 하였다.
워트호그에 탑승한 스파르탄 레드팀은 방벽을 파괴하고 군대에서 쓰는 방법이 아닌 급조된 방식으로 만들어진걸 보아 상황이 긴박했고 방비를 하지 않았다는 것에 의문을 표한다. 그리고 신호가 발송된 것으로 추정되는 곳에서 핸리 램 연구기지를 발견하고 안으로 들어가 연구 기지 AI인 이사벨을 발견한다. 이사벨은 당장 나가야 한다고 하지만 의문의 소리에 레드팀은 이사벨을 확보하고 안으로 들어가지만 그곳에서 정체불명의 적 한명에게 털리는 무시무시한 상황이 벌어졌고 더글라스가 중태에 빠지는 사태가 벌어졌다. 설상가상으로 배니시드 병력 다수가 그들을 잡기 위해 모여들고 있는 상황속에서 빠르게 미사일 폭격 지원으로 받으며 탈출에 성공하지만 그 과정에서 앨리스가 엄호를 하다가 행방불명이 되어버리는 상황에서 제롬은 커터 함장에게 이사벨을 전달하고 이사벨은 아크에서 5개월 전에 아크에서 지구로 향하는 포털이 닫혔다는 것과 한달 뒤에 브루트 지도자 에이트리옥스가 대병력을 이끌고 아크를 점령했다는 것과 그의 강력함에 스피릿 오브 파이어는 약하고 보잘것 없어 당장 멀리 빠르게 도망쳐야 한다고 말한다. 하지만 커터 함장은 이사벨의 말에 불구하고 맞서야 하는 이유를 말하며 임전 태세를 갖춘다.
겨우 한척인것, 맞아. 게다가 낡은 것도 맞고. 그런데, 중요한 건...우린 30년이 지난 지금도 건재하다는 거다. 우리가 알던 전쟁은 끝났어. 예전의 삶으로 돌아갈 수도 없겠지. 우리가 살던 세상은...우리 없이 흘러가 버렸고. 이제 여기에 남은 건 생사를 같이하는 동료...매 전투마다 우리를 지탱해주는 사명감. 그리고 전우애뿐이다. 이사벨, 자네 눈에는 턱없이 부족한 승무원이겠지만...내 눈에 보이는 건 한 식구 같은 용맹한 전사들이야. 싸우다 지옥을 헤쳐나가는 일이 있더라도 절대로, 절대로 등을 보이지 않겠다고 맹세한 영웅들이지. 자네에게는 낡은 함선이겠지만, 나한테는 고향이다. 고향을 위해서라면, 죽도록 싸워봐야지. 지금 에이트리옥스를 막지 못하면, 저 괴물을 은하계에 풀어놓는 것과 다름 없다. 그래서, 우린 어디로도 도망치지 않는다. 알겠나, 이사벨?
하지만 압도적인 병력 차로 인해 정면 승부로는 그냥 자살 행위인지라 배니시드의 지휘 계통을 먼저 없애려고 한다. 먼저 연구 기지를 공격한 장본인인 에이트리옥스의 부관인 데시무스를 먼저 처리하기로 하고 기습 공격으로 상황을 벌인 뒤 남쪽에 기지를 건설해야 한다. 배니시드의 물자 수집 기지를 파괴하면 그자리에 기지를 건설하면서 데시무스의 주의를 끌게 된다. 건설 중에 배니시드의 함선에서 발사된 플라즈마 궤도 공격을 받게 되는데 표시가 되니 그자리에 있는 병력이 있으면 서둘러 빼내주면 된다. 물론 맞더라도 회복 드론 기술로 체력을 회복시키면 된다. 병력을 모아 데시무스의 기지를 없애면 기지에 있는 포탈로 데시무스가 소환된다. 멀리 있는 유닛을 끌어 당겨 근접 공격 뿐만 아니라 자신의 주변으로 포격 공격을 하는데 해병대가 빠르게 삭제 되기에 재빨리 뒤로 물러주며 병력을 보전해야 한다. 폭격이 끝나면 배니시드의 지원 병력도 오기 때문에 일점사로 수송선을 공격하면 병력을 차단 할 수가 있다. 데시무스의 체력이 거의 없어지면 폭격과 전투중에 데시무스 혼자 포탈로 귀환한다. 그리고 자기 병력도 상관하지 않고 폭격을 날리지만 잔해 속에서 데이터를 발견하면서 그 데이터가 카토그래퍼에 관련되었다는 사실을 알게 된다.
카토그래퍼는 아크의 모든 것을 표시하는 지도 시스템인걸 알려주는 이사벨은 에이트리옥스가 그걸 사용해 아크의 중요한 시스템과 무기를 찾아내고 있다고 말한다. 하지만 그곳으로 가려면 선조의 엘리베이터를 이용해야 한다. 선조의 엘리베이터를 이용하려면 통제탑을 이용해 제어권을 얻어야 한다. 올라가다 보면 배니시드의 파괴된 기지가 있는데 커타 함장과 이사벨은 배니시드와 적대를 한다고 우리 편은 아니라고 경고와 주의를 준다. 다리 부근에서 사이클롭스를 활용하고 다시 다리를 연결하려면 제롬을 언덕으로 스파르탄 슬램을 이용해 올려준다. 친절하게 골고이 한마리가 목표가 되어주니 타겟팅해 언덕을 따라가면 배니시드의 레이스가 아래에 있다. 탈취하여 적의 병력을 가법게 처리하고 다리를 연결시켜 후속 병력도 처리하면 배니시드의 채광 기지를 아크의 자기 방어 시스템인 센티널이 파괴하는걸 볼 수 있다. 기지를 건설 할 수 있는 장소에 도착해 기지를 건설하면 앤더스가 임무 목표를 알려준다. 배니시드가 폐쇄해놓은 엘리베이터를 3개의 통제탑을 점령해 폐쇄를 풀어야 한다는 것. 가지고 있는 병력으로는 어림도 없으니 병력을 보강해 탑을 점령한 배니시드 병력을 처리하고 점령해야 한다. 주변의 자원들을 모두 획득하고 배니시드의 물자 저장소를 파괴하면 거기서도 물자가 나오니 빠르게 병력을 모을 수 있다. 배니시드의 소기지를 파괴해 거기에 기지를 건설해두면 좋다. 통제탑 3곳을 모두 점령하면 통제탑 B의 뒤에 있는 엘리베이터 입구에 병력을 보내야 임무가 완료가 되니 주의.
스파르탄 앨리스는 연구소를 무사히 탈출해 배니시드의 후송대를 추적하여 배니시드의 기지에 도착한다. 그곳에 아군 병력이 포로로 잡혀 있었고 이들을 구출해 버려진 연구기지로 가 구조 신호를 보내고 탈출을 하는것이 목표. 단, 연구 기지에 도착해 신호를 보낼 때까지는 사령관 능력은 사용할 수 없다. 스파르탄 슬램으로 가법게 적들을 처리하고 헬브링거들을 구출하고서 곧바로 포로를 구출하러 가진 말고 주변을 샅샅히 돌아 적의 물자 저장소와 전력 저장소를 파괴하고 물자와 전력을 확보하자. 후반에 연구 기지 미션에 중요하게 쓰인다. 워트호그 포로들이 있는 곳은 점프팩 브루드가 있는데 이들이 병력사이로 점프하는걸 허용하면 뼈아프니 튼튼한 스파르탄을 몸빵으로 쓰고 빠르게 처리해주자. 적 병력들이 뭉쳐있으면 스파르탄 슬램으로 기갑 병력도 경직시킬 수 있으니 잘 활용하자. 포로들을 풀어주고 연구 기지에 도착하면 펠리칸이 도착할 때까지 버텨야 한다. 그간 모은 물자와 전력으로 기지 주변에 포탑을 설치해 주고 참호에 병력을 배치해두자. 만약 병력들을 하나도 잃지 않았다면 헬브링거 4분대, 워트호그 4대, 사이클롭스 3기가 있을텐데 해금된 사령관 기술로 체력을 회복시켜주고 적이 오는 방면에 전력을 집중해 처리하자. 후반대에는 적이 많을 시 미사일 폭격도 틈틈히 날려주고 스파르탄 슬램으로 적의 기갑도 탈취해 활용하고 참호 사이 혹은 전투 지역에 회복 드론을 드랍해 병력 손실을 최대한 줄여야 한다. 점점 기갑과 대규모 부대가 몰려오며 약 10여분 정도 버티면 펠리칸이 도착해 앨리스와 병력들을 무사히 구출시킨다. 그리고 그 병력 그대로 앨리스와 함께 배니시드에게 게릴라 작전을 계속하라는 명령이 전해진다. 앨리스는 미션내내 배니시드를 몰랐다.
카토그래퍼에 진입은 했지만 지도실에 도달하기 위해서는 배니시드의 강병과 센티널을 상대해야 한다. 미션을 시작하자 마자 벤시가 날아오지만 타이밍 맞게 투입된 울버린으로 처리...할 순 있지만 기갑에 강한 공중유닛이라 울버린이 빠르게 녹을 수 있으니 보병으로 처리하는게 더 나을 수 있다. 좌측에 선조 도관이 있는데 공격을 하다보면 센티널들이 방어하기 위해 도착한다. 이들을 상대할 수 없으니 빠르게 물려주고 앤더스와 이사벨의 합작 프로젝트인 EMP를 맞으면 센티널들이 물러난다. 다시 도관을 공격해 부수면 앤더스가 지도실로 가는 방어막을 생성시키는 도관 3개를 더 부서야 한다고 목표를 말한다. 병기창에 지원 병력 업그레이드가 있는데 인구수를 20 늘려준다. 앞으로의 미션에서도 필수 업그레이드. 적의 사령관 능력과 대규모 러시로 인해 병력이 빠르게 소모가 되어 도관을 부술 병력이 부족할 수 있지만 천천히 병력을 몰아내고 여러 EMP를 날리는 한이 있더라도 인내심으로 적 병력 처리 후 도관 공격 후 기지 방어로 돌려야 한다. 기지 입구에 지뢰를 매설하면 방어에 도움이 된다. 마지막 북쪽 도관 앞에 기지가 있어 기지를 먼저 밀고 병력을 처리하면 그나마 쉽게 도관을 제거할 수 있다. 북쪽 도관을 제거하면 미션 끝! 인줄 알았지만 기지로 프로텍터 센티널이 공격해 온다. 게다가 대부분의 병력이 북쪽 도관에 새로 생성된 병력과 전투를 벌이느라 올 수 있지 않다. 파괴 전 미리 병력 일부를 대기 시켜 센티널을 처리하고 북쪽 도관 좌우의 소기지를 파괴하고서 프로텍터 센티널이 들어온 길로 병력을 이끌고 가 센티널을 제거하고 지도실 입구에 EMP를 날려주면 미션이 끝난다. 지도실에서 앤더스는 무기 시스템, 생물 자원 라이브러리 등의 아크를 파악 할 수 있다며 놀라워하고 에이트리옥스가 아크의 포털 네크워크를 파악하고 장악해 수백개의 포털을 이용해 아크의 모든 곳을 이동할 수 있음을 파악했다. 커터 함장은 네트워크를 빼앗고 싶었지만 센티널의 공격에 병력을 귀환시켜야 했다.
에이트리옥스의 군대는 강하고 정면의 방어또한 굳건하지만 아크에 멀리 그리고 넓게 분산시키는 실책아닌 실책을 하고 있었다. 배니시드가 점령한 포털 네크워크의 핵심 제어장치를 파괴하면 포털을 마음대로 이용할 수 없게 되기에 일부 병력은 고립되고 대부부는 재배치를 하기 힘들게 만들어 기회를 만들 수 있지만 해당 지역은 이미 배니시드의 대규모 병력이 배치된 상황. 엎친격으로 데시무스가 해당 지역에 있다. 해당 미션에서는 제롬뿐만 아니라 에이트리옥스에게 중상을 입었던 더글라스가 합류한다. 포탈을 제어하고 있는 장치를 파괴하면 해당 포탈을 쓸 수 있다. 두번째 포탈을 제거한 곳에 기지를 건설하고 본격적인 포탈 제어를 위한 전투를 위해 병력을 모으자. 배니시드가 공중 병력을 빠르게 없앨 수 있는 리버를 들고 왔기에 지상 병력으로 리버를 제거하고 공중 병력으로 지상을 없애는 방법이 유용하다. 기지 위로 올라갈 수는 있지만 배니시드의 플라즈마 빔이 내리 꽂고 있어 포탈 이용을 강제당한다. 제어장치를 파괴하면 다음 포탈로 이동이 가능하지만 해당 포탈에 병력이 우글거려 가볍게 보내면 가볍게 사라지니 한방 러시로 가야 한다. 북쪽의 기지를 정리하고 장치를 부수면 섬으로 이동 할 수 있는데 병력과 포탑을 정리하고 포탑을 설치하자. 제어 노드를 파괴하면 데시무스가 등장하고 미션 2와 같이 플라즈마 포격과 리버를 비롯한 지원 병력이 쏟아진다. 데시무스를 처리하면 스피릿 오브 파이어로 배니시드의 공격이 시작되며 병력을 호출되며 미션은 종료.
배니시드의 포탈제어장치를 파괴하고, 간부 중의 한명인 데시무스를 처리했다. 그 뒤 배니시드의 공격이 시작되어 스피릿 오브 파이어는 교전에 들어간다. 그런 한편, 앨리스는 마지막 남은 포탈제어장치와 기지를 지키는 임무를 받는다.
미션이 시작되면 북서쪽 해변으로 배니시드의 공격이 시작되는데, 기존에 배치된 AI 병력은 함포와 상륙부대에 의해 밀린다(난이도 보통 이하의 경우 적절히 보전할 수 있다.). 첫 번째 공세를 막아내고 나면 잠시 소강상태에 들어가는데, 이 시점에서 나이팅게일이 지원된다.(기계와 생체 모두 치료가 가능한 공중지원 유닛으로, 이 미션 이후 회복에 드는 비용을 아낄 수 있어 자주 쓰게 될 것이다.) 기지 주위에 선조 동력 노드, 동력과 물자들이 흩어져 있으므로 다음 공세 전까지 해병들로 입수해주자. 병력 보충에 속도가 붙도록 병력 생산건물은 화력기지 주변의 소기지에 배치하는 것이 좋다.
적들은 기본 시야 기준으로 11시, 12시 해변과 2시에 상륙하는데, 11시는 밴시와 상륙병력, 그리고 바다를 건너오는 로커스트 및 레이스 등 복합적이면서 가장 많은 병력이 침공해 들어온다. 하지만 그런 만큼 포탑 건설지점도 2개, 병력 주둔지도 2개가 있어 병력 배치에 신경쓰면 오래 버틸 수 있다. 다만 신경쓰지 않으면 로커스트에 순식간에 밀리니 이곳 방어를 최우선으로 하자. 12시는 밴시와 상륙부대로 이루어진 공세를 펼치는데, 수는 11시에 비해 적지만 조합이 좋아 상대하기 귀찮다. 주둔지와 포탑은 각각 1개만 주어지고, 한 종류의 병력에 집중하면 다른 상성의 적들을 상대하기 어려우니 조심해야 한다. 2시는 대개 보병 위주로 공격을 펼치는데, 따로 조합이 되지 않아 방어하기 비교적 쉽다. 그러니 우선 병력의 메인은 11시로, 나머지 병력은 12시와 2시를 순환하며 방어하는것으로 하자.
※ 추천조합: 이 수준에서 병력 추가 업그레이드를 통해 더 많은 병력을 배치할 수 있다.
11시: 나이팅게일 2~3기 + 스콜피온 2~3기 + 주둔지병력 + 포탑2기(대기갑 무장) + 앨리스(로커스트 or 레이스 탈취) + (타 지역의 상황이 좋을 경우)추가 사이클롭스 12시: 울버린 2~3기 + 나이팅게일 1기 + 주둔지병력 + 포탑1기(대공 무장)
2시: 나이팅게일 1기 + 주둔지병력 + 포탑배치 사용
12시-2시 순환병력: 스콜피온 0~1기 + 나이팅게일 1기 + 호넷 5~7기
나이팅게일이 추가된 이상 병력을 던지듯 공격하기보단 계속 살려서 베테랑을 만들어주는 것이 유리하니 헬브링어의 비중은 줄여주는 것이 좋다. 주기적으로 공격해오는 11시 적의 로커스트 및 상륙병력 방어와 12시~2시를 순환하며 막다보면 11시 바다에서 스캐럽이 등장한다. 즉시 전 병력을 11시 해변 뒤쪽 포탑라인에 배치한다(12시, 2시의 병력이 오기까지 시간이 걸리니 해변 주둔지의 병력은 버티도록 냅두자.). 기지와 병력을 잘 보전했다면 오히려 다른 공세보다 스캐럽을 더 쉽게 잡을 수 있다(난이도 보통 기준).
스캐럽을 잡고나면 이사벨에게 여전히 스피릿이 공격을 받고 있다며 포탈 방어를 위한 소규모의 기지만 남긴채 이동 준비를 하라는 연락을 받게 된다.
배니시드로부터 선조 입자포를 방어하십시오. 입자포가 캐리어의 방어막을 뚫을 때까지 지켜야 합니다.
스피릿 오브 파이어로 올라가면 신나게 얻어맞고 있는 상황부터 시작된다. 함내 구역에 붉은 구역인 곳도 생기고 함포 손실도 커 12분만 버텨도 경의적인 상황속에서 앤더스가 지원을 요청할 방법을 찾았다. 바로 아크 중심부에 있는 완성 직전의 비상용 헤일로를 이용하는 것. 하지만 필요한 시간은 12시간이고 버틸 수 있는 시간은 앞서 말했듯이 10분도 버티면 기적인 상황. 그 이상 시간을 벌어줄 수 있는 방법이 없는 상태에서 이사벨이 작전을 하나 제안했다. 선조 입자포를 배니시드의 캐리어로 발사해 방어막과 함선에 구멍을 내고 그 안으로 제롬과 이사벨이 잠입해 작전을 벌인다는 것. 물론 이런 짓을 했다간 배니시드의 해당 지역의 모든 병력이 몰려와 선조 입자포를 파괴하려 들게 분명하기 때문에 그곳에 기지를 건설하고 방어를 해야 한다. 입자포를 파괴하기 위해 배니시드의 병력들이 몰려들기 전에 방어선을 구축해야 한다. 기본적으로 포탑을 건설하고 적이 들어오면 그 병력을 압살 할 수 있게 구성하자. 이 병력들을 모조리 끌어 들여 제롬과 이사벨을 캐리어 바로 아래의 배니시드 기지로 잠입시킬 계획도 있어 시간을 꽤 오래 끌어야 한다. 캐리어의 방어막을 뚫는데 필요한 시간은 30분. 후반으로 갈수록 시간이 점점 느리게 가는 듯한 착각을 불러오게 된다. 초반에는 보병 병력이 대다수라 가볍게 막지만 중간중간 떨어지는 플라즈마 함포의 공격과 배니시드의 기술들로 하여금 아까운 병력들의 피해가 난다. 회복 스킬로 잘 회복시키고 지뢰를 길목마다 배치시키면 방어가 한결 수월해진다. 총 3개의 경로로 적들이 오며 입자포의 입구는 2개로 교차로에 병력들을 배치시키고 더글라스와 기동 병력으로 지원이 필요한 길목으로 빠르게 이동해 적들을 막아야 한다. 시간이 가까워질수록 적드르이 병력은 보병이 아니라 기갑과 비행 유닛들로 구성되니 초반에 쉽게 잡겠다고 포탑을 대 보병으로 만들지 말자. 적어도 한군데에는 기갑, 그리고 비행에 적합한 포탑을 건설해두고 더글러스로 괜찮은 배니시드의 기갑이나 비행 유닛을 뺏어 유용하게 사용하자. 입자포가 공격을 받더라도 기본적으로 튼튼하지만 빨리 처리하고 입구에서 시간 벌기까지 한다면 미션은 종료. 캐리어의 방어막이 깨지며 UNSC의 병력들은 빠르게 스피릿으로 후퇴한다.
제롬과 이사벨, 그리고 앨리스와 그녀가 이끄는 부대는 굴하지 않는 신념의 바로 아래 위치한 배니시드의 기지 인근에서 시작된다. 제롬과 이사벨이 탄 펠리칸이 캐리어의 중력 리프트에 다가가다 지키고 있는 병력들에 의해 추락한다. 이제 그들을 지원하기 위해 새로운 유닛인 저격병이 나선다. 생각보다 강력한 유닛이라 처음 쓰는 유저들은 이후 저격병을 주력으로 굴리려고 하는데 그러지 말자. 해당 미션에서 그러한 운용을 한다는걸 보여주는거지, 주력으로 굴리다 기갑이나 비행 유닛을 만나면 그야말로 녹아버린다. 아무튼 이번 미션에서 키포인트 유닛이니 운용을 잘해주자. 저격병을 이끌고 제롬이 추락한 펠리칸까지 가면 혼자서 배니시드의 병력을 처리한 제롬과 함류해 배니시드의 기지로 가야 한다. 제롬은 무지막지한게 튼튼한 스파르탄이라 앞서 혼자 탱킹을 하고 있으면 저격병이 알아서 헌터든 브루트든 처리하니 틈틈히 제롬과 저격병의 체력을 회복시킬 회복 드론을 쏴주자. 도보로 이동하기 위해 우선 배니시드의 기지를 처리할 필요가 있다. 스피릿에서 코디악을 지원해 포격을 날려주고 뒤편에 소기지를 하나 던져주니 지휘관 기술에서 ODST를 확보하고 천천히 움직이자 가는 길에 헌터가 많지만 저격병 4명이 일제사를 날리면 그냥 한방이다. 기지를 처리하고 중력 리프트까지 가지만 리프트는 배니시드의 포탑으로 방어되어 있어 침투가 불가능한 상태. 중장갑 유닛이 필요해지는 시점에서 시점이 제롬에서 앨리스로 넘어가게 된다. 코디악을 만들어 3군데에 배치해야 한다. 물론 코디악이 파괴 되지 않도록 하는것도 중요하다. 배니시드의 지휘관 기술도 많이 업그레이드 되어 잘못하다간 앨리스가 쓰러지고 보병 유닛들도 떼거지로 죽어버리니 병력들을 분산시키는 컨트롤이 필요로 한다. 중간에 위치한 소기지도 점령해 중간 기지로 활용해 가며 3군데에 코디악을 배치하면 제롬이 펠리칸을 타고 재빠르게 착륙해 캐리어로 들어간다. 그리고 해당 병력들도 재빠르게 철수를 한다. 배니시드의 '굴하지 않는 신념'에 잠입한 제롬과 이사벨. 이사벨이 함선의 데이터로 접속해 함포를 작동시킨다. 아크가 공격을 받으면 아크의 방어 시스템인 센티널이 아크를 공격하는 굴하지 않는 신념을 파괴하기 위해 공격할 걸 아는 이사벨은 최대 출력으로 아크를 공격하고 이런 이사벨을 멈추기 위해 함선 내 대기중인 브루트를 비롯한 방어 병력들이 접근하지만 모두 제롬에게 막히고 이내 수많은 센티널들의 자살공격에 함선이 쪼개져 파괴된다.
한편 함선이 파괴된걸 확인한 에이트리옥스는 스파르탄 하나와 AI 하나에게 함선이 파괴되고 헤일로가 떠오른걸 보며 분노하며 전 병력을 헤일로에 투입해 빼앗으라고 명령한다.
작전이 성공하여 굴하지 않는 신념은 파괴되고 헤일로도 무사히 가동 준비를 마친다. 하지만 배니시드의 병력들이 헤일로로 진입을 하려 하고 진입하려는 배니시드의 병력들을 막아내는 것이 목표. 미셔이 시작하자마자 대규모 배니시드 부대가 이동하고 스피릿에서는 막으려고 하지만 바리케이드가 강력해 빈틈이 보이지 않는 상태. 다행히 바리케이드 인근에 배니시드의 스캐럽이 지형이 무너져 발이 묶여있었고 그걸 이용해 바리케이드를 파괴하기로 한다. 차지할 수 있다면. 스캐럽을 확보하려는 길목에 배니시드의 블리스터백이 자리잡고 있다. 강력한 공성 유닛이니 스파르탄들을 이용해 타취하면 유용하게 쓰이니 스파르탄만 이동시켜 병력 피해 받지 말고 탈취하자. 스캐럽 인근에 다다르면 스캐럽 수리를 지휘하는 상헬리 스캐럽 지휘관이 나타나는데 탈취하려면 이녀석을 없애야 한다. 근거리에 강한 녀석이니 함부로 근접전을 벌이지 말고 탱킹을 해줄 스파르탄, 그리고 튼튼한 배니시드 병기들을 앞세우고 처리하자. 지휘관을 처리하면 더글라스가 이벤트로 스캐럽을 탈취하고 스캐럽을 확보하는데 성공한다. 스캐럽으로 길을 막고 있는 바위를 파괴하면 배니시드의 기지가 나타나는데 금방 철거할 수 있지만 데미지를 쉽게 받으니 주의. 회복 드론이나 나이팅게일로 체력을 틈틈히 풀피로 회복시켜 오랫동안 유지시키자. 기지를 확보하면 새로운 미션이 뜨는데 30분 내로 배니시드의 기지들을 없애 병력이 헤일로에 증원을 보내지 못하게 만들어야 한다. 적들도 스캐럽이 위협적인걸 알고 있기에 스캐럽 공격에 효과적인 블리스터백과 밴시등 기갑과 공중 유닛이 주를 이룬다. 그에 맞춰 우리도 그런 유닛을 상대하기 쉬운 유닛들로 함께 구성해 밀고 나가면 된다. 기지는 총 3곳으로 바리케이드 바로 근처, 그리고 입구로 가는 바로 옆, 마지막으로 진입 지점 바로 앞에 위치한 기지이다. 스캐럽에 항상 나이팅게일을 한개 이상 붙이고 3기 정도 나이팅 게일로 나머지 병력들 체력을 유지시키며 밀면 미션은 쉽게 끝낼 수 있다. 배니시드의 진입은 막았지만 헤일로 내부에는 이미 에이트리옥스가 들여보낸 배니시드의 병력들이 상당수여서 더글라스와 앨리스는 헤일로 내부로 이동하여 제롬과 함께 합류하기로 한다.
배니시드의 병력들이 이미 제어실 인근에 자리를 잡은 상태에서 이 제어실로 가야 헤일로를 이용해 배니시드를 격퇴할 수 있다. 에이트리옥스는 스피릿 오브 파이어의 병력들을 인정하고 이만 물러나면 공격하지 않겠다는 말을 하지만 커터 함장은 간단하게 무시하고 기지를 방어할 것을 명령한다. 기지를 향해서 배니시드의 공격을 막아내고 있으면 헤일로 시설에서 가장 강력한 센티널인 리트리버를 내보낸다. 배니시드를 공격하지만 오해하지 말자. 이놈은 아군도 아니다. 기지로 향하는데 파괴하는 것은 불가능하지만 수리를 위해 돌아가게 만들어야 한다. 화면에 리트리버의 체력바가 나타나는데 수리를 위해 돌아가게 된다면 이 체력들이 회복된다. 우리들의 목표는 이런 리트리버 센티널을 이용해 배니시드를 없애기 위해 제어탑을 점령해야 한다. 중간에 아군의 기지가 공격을 받는데 그런 공격들을 방어해주는게 부가 미션이다. 다행히 아군의 기지를 거점으로 사용할 수 있고 인근에 전력 공급 탑들도 많아 확보해두자. 세군데 탑들을 점령하고 3000점을 채우면 리트리버 센티널을 앤더스 교수가 확보해 제어실의 방어막을 여는 것으로 미션은 종료된다.
제어실에서 헤일로를 조정중인 앤더스 교수를 반드시 지켜내야 하는 미션. 배니시드는 무조건 헤일로를 확보하기 위해 방법을 가리지 않고 들어올것이고 스피릿 오브 파이어도 그에 대해 만반의 준비를 갖추고 지원 할 준비를 마쳤다. 이번 미션에서 모든 지휘관 능력이 잠금 해제되고 쿨타임도 줄어들어 유용하게 사용할 수 있다. 포탑을 설치하고 병력들을 배치시키자. 4가지 경로로 적들이 몰려들고 그에 따라 스파르탄을 비롯한 여유 병력들로 분산 배치하든, 한번에 하나씩 빠르게 제거하는 방법도 있다. 시간이 경과될수록 스피릿에서 추가 병력들을 공수해 주며, 방어선 뒤에 있는 배니시드 대전사들을 제거하면 방어선 관리가 한결 편해진다. 물론 무조건 없애라는건 아니고 여유가 된다면. 여유 병력들 가지고 대전사들을 없애러 가다 방어 병력이 모자를 수 있으니 스파르탄과 일부 병력들, 그리고 미사일 폭격과 ODST를 활용해 없애는걸 추천한다.[1] 시간이 중반으로 흐르면 배니시드가 스캐럽을 투입하는데 그에 맞춰 스피릿도 새로운 슈퍼 유닛을 만들었다. 콘도르라는 거대 비행 유닛으로 사실상 마개조의 산실. 지휘관 기술과 함께라면 가법게 처리하고도 한쪽 방면의 방어는 충분히 막아낼 수 있다. 다만 후반으로 가면 스캐럽이 3기나 밀려오고 반대편에서도 병력이 난입해 개판 5분 전이 되지만 스파르탄과 콘도르를 이용해 스캐럽을 처리해주고 주변 병력들을 청소해두자. 모든 스캐럽을 파괴하는 목표가 아니라 최후의 2분을 버티는 목표여서 시간만 잘끄면 승리한다.
배니시드의 병력들이 서쪽 측면에서 포위 대형으로 다가오며 스피릿의 병력들도 배치하여 시간을 끌며 방어해 나가고 있을 무렵, 앤더스는 배니시드의 병력들이 몰려있는 헤일로의 좌표를 모아 포위해는 방어막을 만들고 그걸 손을 들어올리자 해당 헤일로의 구역 또한 앤더스의 행동처럼 공중으로 사출시키며 배니시드를 몰살시킨다. 상황이 종료되어 모두가 함선으로 귀환하고 앤더스 또한 복귀하려 하지만 갑작스럽게 생긴 슬립스페이스로 인해 홀로 헤일로와 같이 이동되었다. 커터 함장은 그런 앤더스 교수의 마지막에 걱정을 하지만 이내 이사벨에게 병력들의 복귀와 지도를 보며 앤더스가 돌아올걸 믿으며 아크에 남아있는 잔존 배니시드에 대한 전투를 대비한다. 한편 에이트리옥스 또한 빼앗긴 헤일로에 대한 분노로 지도를 부쉈지만 건물 밖에 기지를 구축중인 병력들을 보며 아크을 확보하기 위한 전투를 대비한다. 한편 헤일로와 함께 갑자기 슬립스페이스에서 빠져나온 앤더스는 거대한 구조물이 슬립스페이스에서 나오는걸 목격하는데...
[1] 홀로그램을 활용하는 것도 좋은 방법이다. 홀로그램은 공격력은 없지만 시야 확보는 가능한데 홀로그램으로 최대한 많은 유닛을 복제하여 홀로그램만 대전사쪽으로 보낸 후 지휘관 능력을 있는대로 다 쓰면 대전사와 휘하 유닛들을 처리할 수 있다.